Manter aplicações sincronizadas em dois computadores é uma tarefa complicada, principalmente formatar seu computador de uso diários e perder as configurações dos seus programas. O Firefox tem uma função nativa para backup dos bookmarks (favoritos), o que já ajuda muito. Porém, se você faz suas próprias configurações para dar uma melhorada no navegar, elas não irão ser salvas, a não ser que use um programa para isso, e eu vou lhe ajudar nessa tarefa.
O PortProfile é uma boa opção, primeiro por ser extremamente simples de usar e o melhor, é multiplataforma. Escrito em Java, pode-se usar tanto em Linux e Windows quanto Mac OS X. E só requer dois cliques para guardar suas configurações do Firefox.
Basta selecionar o perfil que se quer criar a cópia de segurança, dar um nome e clicar em "Export". Ele vai salvar tanto configurações como extensões, favoritos, histórico e temas. Para resgatar o seu backup é só clicar em "Import" e selecionar o perfil salvo anteriormente.